空间转录组检测

信息概要

空间转录组检测是一种先进的分子生物学技术，能够在组织原位水平上解析基因表达的空间分布信息。该技术结合了高通量测序与空间位置信息，为研究细胞异质性、组织微环境以及疾病机制提供了全新的视角。空间转录组检测的重要性在于其能够揭示基因表达与组织结构的关联，助力精准医学、肿瘤学、发育生物学等领域的研究突破。

该检测服务由第三方机构提供，涵盖样本制备、数据生成与分析全流程，确保结果的准确性与可重复性。通过空间转录组检测，客户可获得高分辨率的基因表达图谱，为科研或临床决策提供可靠依据。

检测项目

• 基因表达空间分布分析
• 细胞类型空间定位
• 组织区域特异性基因标记
• 差异表达基因空间聚类
• 空间共表达网络构建
• 细胞间相互作用分析
• 微环境异质性评估
• 空间可变剪接事件检测
• 空间转录组与蛋白组关联分析
• 疾病标志物空间定位
• 发育轨迹空间重建
• 免疫细胞浸润空间模式
• 肿瘤边界特征基因鉴定
• 空间代谢通路活性图谱
• 神经环路基因表达映射
• 干细胞生态位特征分析
• 空间表观遗传调控研究
• 病原体感染区域特异性响应
• 空间多组学数据整合
• 三维转录组结构建模

检测范围

• 冷冻组织切片
• 石蜡包埋组织
• 肿瘤组织样本
• 脑组织样本
• 心脏组织样本
• 肝脏组织样本
• 肾脏组织样本
• 肺组织样本
• 肠道组织样本
• 皮肤组织样本
• 肌肉组织样本
• 血管组织样本
• 淋巴组织样本
• 胚胎发育组织
• 植物组织样本
• 昆虫组织样本
• 鱼类组织样本
• 类器官模型
• 病理活检样本
• 手术切除样本

检测方法

• Visium空间基因表达技术 - 基于寡核苷酸探针捕获与NGS结合
• Slide-seq - 使用DNA条形码微珠进行空间定位
• MERFISH - 多重荧光原位杂交成像技术
• SeqFISH - 高通量单分子RNA荧光原位杂交
• STARmap - 组织透明化结合原位测序
• DBiT-seq - 微流控芯片引导的空间编码
• High-definition spatial transcriptomics - 纳米孔阵列捕获技术
• LCM-seq - 激光捕获显微切割与测序结合
• GeoMx Digital Spatial Profiler - 区域选择性光切割技术
• Xenium原位分析 - 亚细胞级RNA定位技术
• Stereo-seq - 基于DNA纳米球的高通量方法
• Pixel-seq - 微滴式空间转录组技术
• FISSEQ - 固定组织原位测序技术
• Tomoseq - 三维断层扫描转录组学
• SPLiT-seq - 分裂池连接的空间编码技术

检测仪器

• 10x Genomics Visium系统
• Nanostring GeoMx DSP
• MERFISH成像系统
• Slide-seq微珠阵列平台
• STARmap成像项目合作单位
• DBiT-seq微流控芯片系统
• Xenium原位分析仪
• Stereo-seq测序仪
• LCM激光捕获显微镜
• Illumina NovaSeq测序仪
• Oxford Nanopore测序仪
• Leica共聚焦显微镜
• BD Rhapsody单细胞分析系统
• Fluidigm C1单细胞自动制备系统
• Thermo Fisher QuantStudio实时PCR系统