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大鼠心脏转录组测试

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信息概要

大鼠心脏转录组测试是一项基于高通量测序技术的基因表达分析服务,旨在全面检测大鼠心脏组织中的基因表达谱。该检测通过分析RNA序列,揭示心脏在生理或病理状态下的基因调控机制,为心血管疾病研究、药物筛选及毒性评估提供重要数据支持。

转录组检测的重要性在于能够精准识别差异表达基因、信号通路及功能模块,帮助研究者深入理解心脏发育、疾病发生发展的分子机制,并为生物标志物发现和靶向治疗提供科学依据。

检测项目

  • 总RNA提取质量评估
  • mRNA富集效率检测
  • rRNA残留量分析
  • 文库浓度定量
  • 插入片段大小检测
  • 测序数据产出统计
  • 原始数据质量控制
  • 序列比对率分析
  • 基因表达量计算
  • 差异表达基因筛选
  • GO功能富集分析
  • KEGG通路分析
  • 蛋白互作网络构建
  • 可变剪切事件鉴定
  • 新转录本预测
  • SNP/InDel检测
  • 融合基因检测
  • lncRNA分析
  • circRNA鉴定
  • miRNA-mRNA调控网络分析

检测范围

  • 正常生理状态心脏组织
  • 心肌缺血模型组织
  • 心肌肥厚模型组织
  • 心力衰竭模型组织
  • 心律失常模型组织
  • 药物处理心脏组织
  • 基因敲除心脏组织
  • 转基因心脏组织
  • 衰老模型心脏组织
  • 运动训练心脏组织
  • 高血压模型心脏组织
  • 糖尿病心肌病组织
  • 缺氧处理心脏组织
  • 氧化应激心脏组织
  • 炎症因子刺激组织
  • 毒性物质暴露组织
  • 胚胎发育心脏组织
  • 再生修复心脏组织
  • 移植后心脏组织
  • 不同品系大鼠心脏组织

检测方法

  • TRIzol法 - 用于高质量RNA提取
  • Agilent 2100检测 - RNA完整性评估
  • PolyA筛选 - 真核mRNA富集
  • 链特异性建库 - 保留转录本方向信息
  • Illumina测序 - 高通量双端测序
  • FastQC分析 - 原始数据质控
  • STAR比对 - 基因组定位分析
  • RSEM计算 - 基因表达定量
  • DESeq2分析 - 差异表达检测
  • WGCNA - 基因共表达网络构建
  • StringTie - 转录本组装
  • Cufflinks - 差异剪切分析
  • miRDeep2 - miRNA预测
  • CIRCexplorer - circRNA鉴定
  • Cytoscape - 互作网络可视化

检测仪器

  • Nanodrop分光光度计
  • Qubit荧光定量仪
  • Agilent 2100生物分析仪
  • Illumina NovaSeq 6000
  • Thermal Cycler PCR仪
  • 离心浓缩仪
  • 磁珠纯化系统
  • 电泳系统
  • 超低温离心机
  • 恒温混匀仪
  • 核酸打断仪
  • 自动化液体处理项目合作单位
  • 化学发光成像系统
  • 高通量测序文库制备系统
  • 生物安全柜

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试。

以上是关于大鼠心脏转录组测试的相关介绍,如有其他疑问可以咨询在线工程师为您服务。

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