单细胞RNA测序实验

信息概要

单细胞RNA测序（scRNA-seq）是一种高通量技术，能够在单个细胞水平上解析基因表达谱，揭示细胞异质性、功能状态及发育轨迹。该技术广泛应用于肿瘤学、免疫学、神经科学和发育生物学等领域，为精准医学和基础研究提供关键数据支持。

检测的重要性：单细胞RNA测序能够突破传统批量测序的局限，精准识别稀有细胞群体、解析细胞间差异，并挖掘新的生物标志物或治疗靶点。其检测结果对疾病机制研究、药物开发及临床诊断具有重要指导意义。

检测信息概括：本服务涵盖样本制备、文库构建、测序及数据分析全流程，提供从数百至数万单细胞的转录组数据，支持定制化分析方案，确保数据质量和可重复性。

检测项目

• 细胞捕获效率评估
• 基因检出数统计
• UMI计数分布分析
• 线粒体基因占比检测
• 核糖体基因占比检测
• 双细胞率计算
• 批次效应评估
• 细胞周期阶段鉴定
• 差异表达基因分析
• 细胞亚群聚类分析
• 细胞类型注释
• 拟时序轨迹分析
• 转录因子调控网络预测
• 细胞间通讯分析
• 功能富集分析
• 可变剪切事件检测
• 新转录本发现
• 突变位点检测
• 细胞代谢通路活性评分
• 细胞应激状态评估

检测范围

• 肿瘤组织样本
• 外周血单个核细胞
• 脑组织神经元
• 免疫细胞亚群
• 干细胞及祖细胞
• 胚胎发育细胞
• 循环肿瘤细胞
• 组织驻留巨噬细胞
• 上皮细胞
• 内皮细胞
• 成纤维细胞
• 神经胶质细胞
• 生殖细胞
• 肝细胞
• 心肌细胞
• 肾小球细胞
• 肠道上皮细胞
• 脂肪细胞
• 骨细胞
• 肿瘤微环境细胞

检测方法

• 微流控细胞分选：通过芯片通道实现单细胞分离
• 液滴包裹技术：利用油水相系统生成单细胞微滴
• 磁珠标记捕获：抗体偶联磁珠特异性富集目标细胞
• SMART-seq2：全长转录组扩增方法
• 10x Genomics：基于微流控的高通量方案
• Drop-seq：核酸条形码标记单细胞
• CEL-seq2：线性扩增提高检测灵敏度
• SCRB-seq：通过体外转录实现扩增
• MATQ-seq：检测低丰度转录本
• sNuc-seq：分离细胞核进行测序
• Hi-SCL：单细胞核糖体印记分析
• TCR/BCR测序：免疫受体克隆型追踪
• ATAC-seq：染色质可及性联合分析
• Multiome：转录组与表观组联合检测
• 空间转录组：保留细胞原位信息

检测仪器

• 10x Genomics Chromium
• BD Rhapsody
• Illumina NovaSeq 6000
• Nanopore PromethION
• PacBio Sequel II
• Fluidigm C1
• Mission Bio Tapestri
• Dolomite Bio Nadia
• Bio-Rad ddSEQ
• Singleron GEXSCOPE
• Parse Biosciences Evercode
• BGI MGISEQ-2000
• Thermo Fisher Ion GeneStudio
• Agilent Bravo NGS
• Beckman Coulter MoFlo