高通量RNA定量检测

信息概要

高通量RNA定量检测是一种基于现代分子生物学技术的检测服务，通过大规模并行测序或荧光定量技术，准确测定样本中RNA的表达水平。该检测在基因表达研究、疾病诊断、药物开发及生物标记物筛选等领域具有重要应用价值。通过高通量RNA定量检测，研究人员可以全面了解基因表达谱的变化，为科学研究与临床决策提供可靠的数据支持。

检测项目

• 总RNA浓度检测：测定样本中总RNA的浓度，确保样本质量符合后续分析要求。
• mRNA表达量分析：定量检测特定mRNA的表达水平，用于基因功能研究。
• miRNA表达谱：分析微小RNA的表达模式，探索其在调控网络中的作用。
• lncRNA检测：测定长链非编码RNA的表达量，研究其在疾病中的潜在功能。
• circRNA定量：检测环状RNA的表达水平，分析其与疾病的相关性。
• rRNA完整性评估：通过电泳或芯片评估rRNA的完整性，判断样本降解程度。
• 转录组测序：全面分析样本中所有转录本的表达情况。
• 差异表达基因筛选：通过对比不同样本，筛选显著差异表达的基因。
• 可变剪接分析：检测基因的可变剪接事件，研究其生物学意义。
• 基因融合检测：识别样本中可能存在的基因融合现象。
• SNP检测：分析RNA中的单核苷酸多态性，探索其与表型的关联。
• RNA编辑分析：检测RNA编辑事件，研究其在基因调控中的作用。
• 外显子表达量测定：定量分析特定外显子的表达水平。
• 启动子活性分析：通过RNA定量评估启动子的转录活性。
• polyA尾长度检测：测定mRNA的polyA尾长度，研究其稳定性与翻译效率。
• RNA甲基化分析：检测RNA甲基化修饰，探索表观转录组学的调控机制。
• 病毒RNA检测：定量分析病毒RNA载量，用于感染诊断与研究。
• 细菌RNA检测：测定细菌RNA的表达水平，研究微生物组的功能。
• 细胞特异性标记物检测：分析特定细胞类型标记RNA的表达情况。
• 肿瘤标志物筛查：通过RNA定量检测潜在的肿瘤标志物。
• 免疫相关基因表达：定量分析免疫相关基因的表达水平。
• 代谢通路基因检测：测定参与特定代谢通路的基因表达量。
• 应激反应基因分析：研究细胞在应激条件下基因表达的变化。
• 发育阶段标志物检测：分析不同发育阶段特异性RNA的表达模式。
• 药物靶点基因表达：定量检测药物靶点基因的RNA水平。
• 耐药基因筛查：分析可能与耐药性相关的基因表达变化。
• 凋亡相关基因检测：测定凋亡通路中关键基因的表达量。
• 细胞周期基因分析：研究细胞周期调控基因的表达模式。
• 神经递质相关基因检测：分析神经递质合成与代谢相关基因的表达。
• 表观遗传调控基因检测：定量研究与表观遗传调控相关的RNA分子。

检测范围

• mRNA
• miRNA
• lncRNA
• circRNA
• rRNA
• tRNA
• snRNA
• snoRNA
• scaRNA
• piRNA
• eRNA
• PROMPTs
• TSS-RNAs
• PASRs
• PROMPs
• PROMPT-RNAs
• tiRNAs
• siRNAs
• shRNAs
• viral RNAs
• bacterial RNAs
• fungal RNAs
• plant RNAs
• mitochondrial RNAs
• chloroplast RNAs
• ribozymes
• antisense RNAs
• sense RNAs
• bidirectional RNAs
• enhancer RNAs

检测方法

• RNA-Seq：基于高通量测序技术的转录组分析方法。
• qRT-PCR：实时荧光定量PCR，用于准确测定特定RNA的表达量。
• 微阵列芯片：通过杂交技术同时检测数千种RNA的表达水平。
• Nanostring nCounter：基于数字条形码技术的无扩增RNA定量方法。
• Digital PCR：数字PCR技术，实现绝对定量检测。
• SMART-Seq：全长转录本测序方法，适用于低起始量样本。
• Drop-Seq：单细胞转录组测序技术，用于分析单个细胞的基因表达。
• 10x Genomics：高通量单细胞RNA测序平台。
• CAGE：捕获和分析转录起始位点的技术。
• RACE：快速扩增cDNA末端，用于确定RNA的5'和3'末端。
• Northern Blot：传统RNA检测技术，用于特定RNA的定性与半定量。
• Ribosome Profiling：核糖体足迹测序，研究翻译中的RNA。
• CLIP-Seq：紫外交联免疫沉淀测序，研究RNA-蛋白质相互作用。
• PAR-CLIP：光活化核糖核苷增强的CLIP技术。
• SHAPE-MaP：通过化学探针研究RNA二级结构的方法。
• DMS-Seq：二甲基硫酸盐测序，分析RNA结构。
• icSHAPE：改进的SHAPE技术，用于全转录组结构分析。
• SLAM-Seq：代谢标记RNA测序，追踪新生RNA。
• TUC-Seq：时间分辨尿苷标记测序技术。
• Bru-Seq：溴尿苷标记RNA测序。
• GRO-Seq：核运行测序，检测转录中的RNA聚合酶。
• NET-Seq：天然延伸转录本测序。
• PRO-Seq：准确核运行测序。
• TT-Seq：翻译转录组测序。
• Ribo-Seq：核糖体保护片段测序。

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• Thermo Fisher QuantStudio 7
• Agilent 2100 Bioanalyzer
• Nanostring nCounter
• Bio-Rad QX200 Droplet Digital PCR
• 10x Genomics Chromium
• PacBio Sequel II
• Oxford Nanopore MinION
• Qiagen QIAcube
• Beckman Coulter Biomek
• PerkinElmer LabChip GX
• Tecan Infinite 200
• Eppendorf Mastercycler
• Applied Biosystems 7500 Fast
• BioTek Synergy H1