人源肿瘤小鼠基因组不稳定性测试

信息概要

人源肿瘤小鼠基因组不稳定性测试是一种用于评估小鼠模型中肿瘤基因组稳定性的重要检测服务。该测试通过分析小鼠肿瘤组织的基因组变异情况，为肿瘤发生机制研究、药物筛选及个性化治疗提供关键数据。基因组不稳定性是肿瘤发生和发展的重要特征之一，通过该测试可以揭示肿瘤的遗传变异模式，为临床前研究提供科学依据。

该检测服务广泛应用于肿瘤生物学研究、抗癌药物开发以及肿瘤治疗策略优化等领域。通过高通量测序和生物信息学分析，能够全面检测基因组中的突变、拷贝数变异、结构变异等，为科研和医药研发提供精准的数据支持。

检测项目

• 单核苷酸变异（SNV）检测
• 插入缺失（Indel）分析
• 拷贝数变异（CNV）检测
• 结构变异（SV）分析
• 微卫星不稳定性（MSI）检测
• 杂合性缺失（LOH）分析
• 染色体不稳定性（CIN）评估
• 端粒长度检测
• 基因融合分析
• 全基因组测序（WGS）
• 全外显子测序（WES）
• 转录组测序（RNA-Seq）
• 甲基化水平分析
• 染色质可及性检测
• 肿瘤突变负荷（TMB）计算
• 同源重组缺陷（HRD）评分
• 肿瘤异质性分析
• 驱动基因突变筛查
• 肿瘤进化树构建
• 病毒整合位点检测

检测范围

• 人源化PDX小鼠模型
• 转基因肿瘤小鼠模型
• 异种移植肿瘤小鼠模型
• 条件性敲除肿瘤小鼠模型
• 化学诱导肿瘤小鼠模型
• 辐射诱导肿瘤小鼠模型
• 自发肿瘤小鼠模型
• 免疫缺陷肿瘤小鼠模型
• 基因编辑肿瘤小鼠模型
• 器官特异性肿瘤小鼠模型
• 多发性肿瘤小鼠模型
• 转移性肿瘤小鼠模型
• 耐药性肿瘤小鼠模型
• 原发肿瘤小鼠模型
• 复发肿瘤小鼠模型
• 罕见肿瘤小鼠模型
• 血液系统肿瘤小鼠模型
• 实体瘤小鼠模型
• 遗传性肿瘤小鼠模型
• 肿瘤干细胞小鼠模型

检测方法

• 高通量测序（NGS）：通过大规模并行测序技术检测基因组变异
• Sanger测序：用于验证特定基因区域的突变
• 荧光原位杂交（FISH）：检测染色体结构异常
• 比较基因组杂交（CGH）：分析拷贝数变异
• 数字PCR（dPCR）：准确定量特定DNA序列
• 实时荧光定量PCR（qPCR）：检测基因表达水平和拷贝数变化
• 甲基化特异性PCR（MSP）：分析DNA甲基化状态
• 染色质免疫沉淀测序（ChIP-Seq）：研究蛋白质-DNA相互作用
• ATAC-Seq：检测染色质可及性
• 单细胞测序：分析肿瘤细胞异质性
• 质谱分析：检测蛋白质表达和修饰
• 流式细胞术：评估细胞周期和DNA含量
• 免疫组化（IHC）：检测蛋白质表达和定位
• Southern blot：分析DNA片段大小和数量
• Northern blot：检测RNA表达水平

检测仪器

• Illumina NovaSeq测序仪
• Thermo Fisher Ion GeneStudio S5
• ABI 3730xl DNA分析仪
• Nanopore MinION测序仪
• Bio-Rad QX200微滴式数字PCR系统
• Applied Biosystems 7500实时PCR系统
• Leica DM6000荧光显微镜
• Agilent 2100生物分析仪
• Beckman Coulter CytoFLEX流式细胞仪
• Thermo Scientific Orbitrap质谱仪
• PerkinElmer Operetta高内涵成像系统
• Zeiss LSM 880共聚焦显微镜
• Bio-Rad ChemiDoc MP成像系统
• Thermo Fisher QuantStudio 12K Flex实时PCR系统
• 10x Genomics Chromium单细胞平台