纳米孔测序检测

信息概要

纳米孔测序检测是一种基于纳米孔技术的第三代测序方法，通过测量DNA或RNA分子通过纳米孔时产生的电信号变化，实现对核酸序列的高通量、实时检测。该技术具有读长长、速度快、便携性强等优势，广泛应用于基因组学、转录组学、病原体检测等领域。第三方检测机构提供的纳米孔测序服务，可为科研、医疗、农业等行业提供精准的基因序列信息，助力疾病诊断、物种鉴定、药物开发等研究。

纳米孔测序检测的重要性在于其能够快速获取长片段序列信息，弥补传统测序技术的不足，尤其在复杂基因组组装、结构变异检测、表观遗传学研究中具有独特优势。此外，其便携性使其在野外或现场检测中发挥重要作用，例如传染病暴发时的快速病原鉴定。

检测项目

• 基因组测序：检测生物体全基因组序列，用于物种鉴定和进化分析
• 转录组测序：分析基因表达谱，研究细胞功能状态
• 全长RNA测序：获取完整转录本信息，研究可变剪切事件
• 宏基因组测序：分析环境样本中的微生物群落组成
• 病原体检测：快速鉴定细菌、病毒等病原微生物
• 抗生素耐药基因检测：分析微生物耐药性特征
• 甲基化分析：检测DNA表观遗传修饰
• 单细胞测序：研究单个细胞的基因组或转录组特征
• 结构变异检测：识别基因组中大片段插入、缺失等变异
• 融合基因检测：发现染色体易位导致的异常基因融合
• 病毒分型：确定病毒亚型和进化关系
• SNP检测：识别单核苷酸多态性位点
• INDEL检测：发现小片段插入缺失变异
• CNV分析：检测拷贝数变异
• 端粒测序：研究染色体末端重复序列
• 线粒体基因组测序：分析线粒体DNA突变
• 叶绿体基因组测序：用于植物系统发育研究
• CRISPR编辑验证：确认基因编辑效果
• 质粒测序：分析质粒DNA序列结构
• 噬菌体测序：研究噬菌体基因组特征
• 环境DNA检测：从环境样本中获取生物DNA信息
• 食品溯源：通过DNA分析确定食品来源
• 古DNA测序：研究古代生物遗传信息
• 微生物多样性分析：评估样本中微生物种类丰富度
• 病毒载量定量：测定病毒基因组拷贝数
• 基因表达定量：准确测量基因转录水平
• lncRNA测序：研究长链非编码RNA功能
• circRNA测序：分析环状RNA分子特征
• miRNA测序：检测微小RNA表达谱
• 病毒基因组组装：重建完整病毒基因组序列

检测范围

• 人类基因组
• 动物基因组
• 植物基因组
• 细菌基因组
• 病毒基因组
• 真菌基因组
• 古菌基因组
• 质粒DNA
• 噬菌体DNA
• 线粒体DNA
• 叶绿体DNA
• 环境DNA
• 食品DNA
• 古DNA
• 临床样本DNA
• 法医样本DNA
• 单细胞DNA
• 循环游离DNA
• 外泌体RNA
• 总RNA
• mRNA
• lncRNA
• circRNA
• miRNA
• siRNA
• rRNA
• tRNA
• 病毒RNA
• 细菌RNA
• 植物RNA

检测方法

• DNA纳米孔测序：利用纳米孔技术直接测序DNA分子
• RNA直接测序：无需逆转录直接测序RNA分子
• PCR扩增测序：通过PCR富增目标序列后测序
• 全基因组测序：无偏倚地测序整个基因组
• 靶向测序：针对特定基因区域进行测序
• 甲基化测序：检测DNA甲基化修饰
• 单分子测序：对单个DNA分子进行测序
• 长读长测序：获取超长片段序列信息
• 多重测序：同时测序多个样本
• 实时测序：边测序边获取数据
• 宏基因组测序：分析复杂样本中所有微生物DNA
• 转录组测序：全面分析基因表达情况
• 全长转录本测序：获取完整mRNA序列
• 小RNA测序：专门测序小分子RNA
• 链特异性测序：保留转录本链方向信息
• 空间转录组测序：保留RNA空间位置信息
• 单细胞测序：分析单个细胞的基因组或转录组
• 表观基因组测序：研究DNA修饰全貌
• 染色质可及性测序：分析开放染色质区域
• Hi-C测序：研究染色体三维结构
• ChIP测序：分析蛋白质-DNA相互作用
• RIP测序：研究RNA-蛋白质相互作用
• CLIP测序：准确鉴定RNA结合蛋白靶点
• 代谢组关联测序：整合代谢物与基因表达数据
• 时间序列测序：追踪样本随时间变化的基因表达

检测方法

• Oxford Nanopore MinION
• Oxford Nanopore GridION
• Oxford Nanopore PromethION
• Oxford Nanopore Flongle
• Oxford Nanopore SmidgION
• Oxford Nanopore VolTRAX
• Oxford Nanopore Zumbador
• Oxford Nanopore LSK-109
• Oxford Nanopore SQK-LSK109
• Oxford Nanopore SQK-RAD004
• Oxford Nanopore SQK-RBK004
• Oxford Nanopore SQK-PCB109
• Oxford Nanopore EXP-NBD104
• Oxford Nanopore EXP-NBD114
• Oxford Nanopore EXP-PBC001