小鼠甲基化实验

信息概要

小鼠甲基化实验是一种通过分析DNA甲基化修饰来研究基因表达调控的重要技术。该实验广泛应用于表观遗传学、疾病机制研究、药物开发等领域。DNA甲基化作为表观遗传修饰的关键形式，对基因沉默、基因组稳定性以及细胞分化等生物学过程具有重要影响。通过检测小鼠样本中的甲基化水平，可以揭示疾病发生发展的分子机制，为精准医疗和生物标记物发现提供科学依据。

检测项目

• 全基因组甲基化水平检测
• 特定基因启动子区域甲基化分析
• CpG岛甲基化状态检测
• 差异甲基化区域(DMR)鉴定
• 甲基化特异性PCR(MSP)
• 亚硫酸氢盐测序(Bisulfite Sequencing)
• 甲基化敏感限制性内切酶分析
• 甲基化DNA免疫共沉淀(MeDIP)
• 高通量甲基化芯片分析
• 单细胞甲基化测序
• 甲基化位点定量分析
• 甲基化与基因表达关联分析
• 跨代甲基化变化检测
• 组织特异性甲基化图谱构建
• 疾病相关甲基化标记筛查
• 环境因素对甲基化影响评估
• 药物处理对甲基化模式改变
• 年龄相关甲基化变化分析
• 甲基化与表型关联研究
• 甲基化生物标志物验证

检测范围

• 小鼠血液样本
• 小鼠组织样本(肝、脑、肾等)
• 小鼠肿瘤组织
• 小鼠胚胎组织
• 小鼠干细胞
• 小鼠生殖细胞
• 小鼠神经细胞
• 小鼠免疫细胞
• 小鼠原代细胞
• 小鼠细胞系
• 小鼠外泌体DNA
• 小鼠循环游离DNA
• 小鼠粪便DNA
• 小鼠唾液DNA
• 小鼠毛发DNA
• 小鼠石蜡包埋组织
• 小鼠冷冻组织
• 小鼠新鲜组织
• 小鼠培养细胞
• 小鼠微生物组DNA

检测方法

• 亚硫酸氢盐转化法：将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶，保留甲基化胞嘧啶
• 甲基化特异性PCR(MSP)：设计特异性引物区分甲基化和非甲基化DNA
• 亚硫酸氢盐测序：对转化后的DNA进行测序，准确定位甲基化位点
• 焦磷酸测序：定量分析特定CpG位点的甲基化水平
• 甲基化芯片：高通量检测全基因组范围内的甲基化状态
• 全基因组重亚硫酸盐测序(WGBS)：单碱基分辨率分析全基因组甲基化
• 简化代表性亚硫酸盐测序(RRBS)：经济地检测高CpG含量区域
• 甲基化DNA免疫沉淀测序(MeDIP-seq)：抗体富集甲基化DNA后进行测序
• 甲基化敏感限制性内切酶-PCR：利用酶切差异检测甲基化状态
• 联合亚硫酸氢盐限制性分析(COBRA)：结合酶切和PCR检测甲基化
• 甲基化荧光定量PCR：高灵敏度定量检测特定区域甲基化
• 数字甲基化分析：单分子水平的甲基化检测
• 纳米孔直接甲基化测序：无需亚硫酸盐转化的直接测序方法
• 多重甲基化特异性PCR：同时检测多个基因的甲基化状态
• 甲基化单倍型分析：研究相邻CpG位点的共甲基化模式

检测仪器

• Illumina测序仪
• PyroMark Q96 ID系统
• Agilent甲基化芯片扫描仪
• Nanopore测序仪
• 实时荧光定量PCR仪
• 毛细管电泳仪
• 微滴式数字PCR系统
• 超液相色谱仪
• 质谱仪
• 凝胶成像系统
• 核酸定量仪
• 生物分析仪
• 自动化液体处理项目合作单位
• 超速离心机
• 恒温金属浴