二代测序实验

信息概要

二代测序（Next-Generation Sequencing, NGS）是一种高通量、高精度的DNA/RNA测序技术，广泛应用于基因组学、转录组学、表观遗传学等领域。该技术能够快速、准确地获取生物样本的遗传信息，为疾病诊断、药物研发、农业育种等提供关键数据支持。

检测的重要性：二代测序技术能够全面解析基因组信息，帮助发现疾病相关突变、病原微生物检测、肿瘤分子分型等，为精准医疗和科学研究提供重要依据。通过高质量的检测服务，客户可以获得可靠的数据支持，推动科研和临床应用的进展。

检测项目

• 全基因组测序：对样本的全部基因组DNA进行测序，获取完整的遗传信息。
• 全外显子组测序：针对外显子区域进行测序，检测编码区的变异。
• 转录组测序：分析样本中所有RNA的表达水平，研究基因调控机制。
• 单细胞测序：对单个细胞进行基因组或转录组测序，揭示细胞异质性。
• 甲基化测序：检测DNA甲基化状态，研究表观遗传调控。
• ChIP-seq：通过免疫沉淀结合测序，分析蛋白质与DNA的相互作用。
• 宏基因组测序：对环境样本中的微生物群落进行测序，研究微生物多样性。
• 肿瘤突变检测：识别肿瘤样本中的体细胞突变，辅助精准治疗。
• 遗传病筛查：检测与遗传病相关的基因突变，辅助临床诊断。
• 病原微生物检测：快速鉴定样本中的病原微生物，用于感染性疾病诊断。
• SNP分型：检测单核苷酸多态性，用于群体遗传学研究。
• CNV检测：分析拷贝数变异，研究基因组结构变化。
• 融合基因检测：识别基因融合事件，尤其适用于癌症研究。
• miRNA测序：对小RNA进行测序，研究非编码RNA的功能。
• lncRNA测序：对长链非编码RNA进行测序，探索其调控作用。
• circRNA测序：分析环状RNA的表达和功能。
• 病毒基因组测序：对病毒基因组进行测序，研究病毒变异和进化。
• 细菌基因组测序：对细菌基因组进行测序，用于病原体鉴定和耐药性分析。
• 真菌基因组测序：对真菌基因组进行测序，研究其生物学特性。
• 植物基因组测序：对植物基因组进行测序，辅助育种研究。
• 动物基因组测序：对动物基因组进行测序，用于遗传育种和进化研究。
• 免疫组库测序：分析T细胞和B细胞受体多样性，研究免疫应答。
• 空间转录组测序：结合空间信息的转录组分析，研究组织微环境。
• 表观组测序：全面分析表观遗传修饰，研究基因表达调控。
• 代谢组关联分析：结合代谢组数据，研究基因与代谢的关系。
• 药物靶点测序：检测药物靶点基因的变异，指导个性化用药。
• 生殖遗传检测：筛查胚胎或生殖细胞的遗传异常，辅助生殖医学。
• 环境DNA测序：对环境样本中的DNA进行测序，监测生物多样性。
• 古DNA测序：对古代生物样本的DNA进行测序，研究进化历史。
• 多组学整合分析：结合基因组、转录组、蛋白组等多组学数据，进行系统生物学研究。

检测范围

• 人类基因组
• 动物基因组
• 植物基因组
• 微生物基因组
• 病毒基因组
• 细菌基因组
• 真菌基因组
• 古生物基因组
• 环境微生物组
• 肿瘤基因组
• 生殖细胞基因组
• 胚胎基因组
• 免疫组库
• 转录组
• 表观基因组
• 单细胞基因组
• 空间转录组
• 环状RNA
• 长链非编码RNA
• 小RNA
• 融合基因
• 拷贝数变异
• 单核苷酸多态性
• 结构变异
• 甲基化位点
• 染色质互作
• 病原微生物
• 耐药基因
• 代谢相关基因
• 药物靶点基因

检测方法

• Illumina测序：基于边合成边测序原理的高通量测序技术。
• Ion Torrent测序：通过检测氢离子释放进行测序的技术。
• PacBio SMRT测序：利用单分子实时测序技术，获得长读长数据。
• Oxford Nanopore测序：基于纳米孔技术的实时长读长测序方法。
• 10x Genomics：结合微流控的单细胞测序技术。
• Hi-C测序：研究三维基因组结构的测序方法。
• ATAC-seq：检测染色质可及性的测序技术。
• RIP-seq：研究RNA结合蛋白与RNA互作的测序方法。
• CLIP-seq：分析蛋白质与RNA交联的测序技术。
• MeDIP-seq：甲基化DNA免疫沉淀测序技术。
• RRBS：简化代表性亚硫酸氢盐测序技术。
• WGBS：全基因组亚硫酸氢盐测序技术。
• scRNA-seq：单细胞RNA测序技术。
• scATAC-seq：单细胞染色质可及性测序技术。
• smRNA-seq：小RNA测序技术。
• CUT&Tag：研究蛋白质-DNA互作的新一代测序技术。
• DAP-seq：研究转录因子结合位点的测序技术。
• ChIA-PET：研究染色质互作的测序技术。
• 4C-seq：研究染色质环状互作的测序技术。
• 5C-seq：研究染色质三维结构的测序技术。
• SHARE-seq：结合染色质和转录组信息的单细胞测序技术。
• snmC-seq：单细胞甲基化测序技术。
• SPLiT-seq：低成本单细胞转录组测序技术。
• MERFISH：空间转录组成像技术。
• Slide-seq：高分辨率空间转录组测序技术。

检测仪器

• Illumina NovaSeq
• Illumina HiSeq
• Illumina MiSeq
• Illumina NextSeq
• Ion GeneStudio S5
• Ion Torrent PGM
• PacBio Sequel II
• Oxford Nanopore MinION
• Oxford Nanopore GridION
• Oxford Nanopore PromethION
• 10x Genomics Chromium
• BGI MGISEQ
• BGI DNBSEQ
• Thermo Fisher QuantStudio
• Agilent Bioanalyzer