人源肿瘤小鼠lncRNA检测

信息概要

人源肿瘤小鼠lncRNA检测是一种基于人源肿瘤异种移植模型（PDX）的长链非编码RNA（lncRNA）分析服务，旨在通过高通量技术揭示肿瘤发生、发展及耐药性相关的lncRNA调控机制。该检测对肿瘤精准医疗研究具有重要意义，可为靶向治疗、生物标志物筛选及药物开发提供关键数据支持。

检测项目

• lncRNA表达谱分析
• 差异表达lncRNA筛选
• lncRNA与mRNA共表达网络构建
• lncRNA功能富集分析
• lncRNA亚细胞定位预测
• lncRNA与蛋白质相互作用预测
• 肿瘤特异性lncRNA标志物鉴定
• lncRNA可变剪接分析
• lncRNA甲基化修饰检测
• lncRNA与miRNA竞争结合分析
• lncRNA在信号通路中的作用评估
• lncRNA保守性分析
• lncRNA结构预测
• lncRNA与染色质互作分析
• lncRNA在肿瘤转移中的功能验证
• lncRNA与免疫微环境关联分析
• lncRNA拷贝数变异检测
• lncRNA转录起始位点定位
• lncRNA稳定性评估
• lncRNA与临床预后相关性分析

检测范围

• 人源肝癌PDX模型
• 人源肺癌PDX模型
• 人源乳腺癌PDX模型
• 人源结直肠癌PDX模型
• 人源胃癌PDX模型
• 人源胰腺癌PDX模型
• 人源卵巢癌PDX模型
• 人源前列腺癌PDX模型
• 人源脑胶质瘤PDX模型
• 人源黑色素瘤PDX模型
• 人源肾癌PDX模型
• 人源膀胱癌PDX模型
• 人源食管癌PDX模型
• 人源甲状腺癌PDX模型
• 人源骨肉瘤PDX模型
• 人源淋巴瘤PDX模型
• 人源白血病PDX模型
• 人源头颈部肿瘤PDX模型
• 人源神经内分泌瘤PDX模型
• 人源肉瘤PDX模型

检测方法

• RNA-seq高通量测序：全转录组范围内lncRNA定量与鉴定
• qRT-PCR：特定lncRNA表达水平验证
• Northern Blot：lncRNA大小及表达量检测
• 荧光原位杂交（FISH）：lncRNA空间分布可视化
• ChIRP-seq：lncRNA与染色质互作位点分析
• RIP-seq：lncRNA结合蛋白鉴定
• CLIP-seq：lncRNA与RNA结合蛋白相互作用研究
• 甲基化特异性PCR：lncRNA启动子甲基化状态检测
• Nanostring nCounter：多重lncRNA表达谱分析
• 单细胞RNA-seq：肿瘤微环境中lncRNA异质性研究
• CRISPR干扰：lncRNA功能缺失性验证
• RNA pull-down：lncRNA结合蛋白筛选
• LC-MS/MS：lncRNA相关蛋白组分析
• RNA结构探针：lncRNA二级结构解析
• 生物信息学预测：lncRNA功能与调控网络建模

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• ABI QuantStudio 7 Flex
• Agilent 2100 Bioanalyzer
• Nanostring nCounter
• Zeiss LSM 880
• Thermo Fisher Q Exactive HF-X
• Bio-Rad ChemiDoc MP
• Beckman Coulter CytoFLEX
• Oxford Nanopore GridION
• PerkinElmer Operetta CLS
• Miltenyi Biotec MACSQuant
• Thermo Fisher Invitrogen Countess II
• Eppendorf Mastercycler X50
• Biorad CFX96 Touch
• Affymetrix GeneChip Scanner 3000