变异链球菌耐药克隆防控检测

信息概要

变异链球菌耐药克隆防控检测是一项针对口腔致病菌变异链球菌的耐药性及克隆传播特性的检测服务。该检测通过分析细菌的耐药基因、克隆分型及传播特征，为临床治疗和公共卫生防控提供科学依据。

耐药性变异链球菌的传播可能引发治疗失败或感染扩散，因此早期检测对指导抗生素合理使用、阻断克隆传播链至关重要。本检测服务覆盖耐药基因筛查、克隆分型及流行病学溯源等多维度分析，助力精准防控。

检测项目

• 变异链球菌分离培养
• 细菌DNA提取
• 16S rRNA基因测序
• ermB耐药基因检测
• mefA耐药基因检测
• tetM耐药基因检测
• 青霉素结合蛋白基因突变分析
• MLST分子分型
• PFGE脉冲场凝胶电泳分型
• SCCmec基因盒检测
• 生物膜形成能力测定
• 最小抑菌浓度(MIC)测定
• β-内酰胺酶活性检测
• 大环内酯类耐药表型验证
• 四环素耐药表型验证
• 氟喹诺酮耐药基因筛查
• 转座子整合酶基因检测
• 毒力因子基因检测
• 基因组测序与耐药基因注释
• 克隆复合体(CC)分类

检测范围

• 临床分离变异链球菌
• 口腔拭子样本
• 牙菌斑样本
• 龋齿病变组织
• 根管感染样本
• 唾液样本
• 种植体周围炎样本
• 牙周袋分泌物
• 儿童乳牙菌斑
• 正畸托槽附着菌斑
• 义齿基板菌斑
• 医院环境采样标本
• 牙科用水系统样本
• 抗生素压力筛选菌株
• 历史保存菌株
• 动物源性变异链球菌
• 食品加工环境分离株
• 母婴传播研究样本
• 口腔益生菌竞争株
• 基因工程改造菌株

检测方法

• 实时荧光定量PCR：靶向耐药基因的快速定量检测
• Sanger测序：耐药基因突变位点准确分析
• 多位点序列分型(MLST)：基于7个管家基因的标准化分型
• 全基因组测序：高通量解析耐药基因与克隆特征
• 脉冲场凝胶电泳(PFGE)：大片段DNA分离用于克隆溯源
• 微量肉汤稀释法：抗生素敏感性定量测定
• E-test法：抗生素梯度浓度测试
• 微流控芯片技术：快速多重耐药基因筛查
• 荧光原位杂交(FISH)：耐药基因空间定位
• 质粒接合转移实验：水平基因转移能力评估
• 生物发光报告系统：实时监测基因表达
• 质谱快速鉴定(MALDI-TOF)：菌株快速分型
• CRISPR分型：基于细菌免疫系统的分型技术
• 宏基因组测序：复杂样本中耐药基因挖掘
• 单细胞基因组测序：稀有耐药克隆分析

检测仪器

• 实时荧光定量PCR仪
• 全自动微生物鉴定系统
• 脉冲场凝胶电泳系统
• 二代测序仪
• Nanopore测序仪
• 自动化核酸提取仪
• 凝胶成像系统
• 生物安全柜
• CO2培养箱
• 厌氧培养项目合作单位
• 酶标仪
• 微量稀释板读数仪
• 质谱仪(MALDI-TOF)
• 超微量分光光度计
• 流式细胞仪