人源肿瘤小鼠染色体外DNA测试

信息概要

人源肿瘤小鼠染色体外DNA测试是一种先进的分子检测技术，专注于分析小鼠模型中肿瘤细胞的染色体外DNA（ecDNA）特征。该检测对于研究肿瘤异质性、耐药性机制以及个性化治疗策略的开发具有重要意义。通过精准检测ecDNA的异常扩增和结构变异，可为肿瘤生物学研究和临床前药物评估提供关键数据支持。

检测项目

• ecDNA拷贝数变异分析
• ecDNA结构变异检测
• 肿瘤驱动基因扩增筛查
• ecDNA携带的融合基因鉴定
• 微卫星不稳定性分析
• 肿瘤突变负荷评估
• ecDNA甲基化水平检测
• 环状DNA全基因组测序
• 癌基因共扩增模式分析
• ecDNA大小分布测定
• 染色体断裂点定位
• 肿瘤异质性评分
• ecDNA转录活性检测
• 耐药相关基因检测
• ecDNA进化轨迹追踪
• 肿瘤干细胞标志物分析
• ecDNA核内定位成像
• 微环境调控基因检测
• 免疫治疗靶点筛查
• ecDNA动态监测

检测范围

• PDX模型ecDNA检测
• CDX模型ecDNA分析
• 转基因小鼠肿瘤模型
• 异种移植瘤模型
• 化学诱导肿瘤模型
• 放射诱导肿瘤模型
• 自发肿瘤小鼠模型
• 基因敲除肿瘤模型
• 人源化免疫系统肿瘤模型
• 原位移植肿瘤模型
• 转移性肿瘤模型
• 多发性骨髓瘤模型
• 白血病小鼠模型
• 乳腺癌小鼠模型
• 肺癌小鼠模型
• 结直肠癌小鼠模型
• 前列腺癌小鼠模型
• 胶质瘤小鼠模型
• 胰腺癌小鼠模型
• 肝癌小鼠模型

检测方法

• 全基因组测序（WGS）：高通量检测ecDNA全序列信息
• 环状DNA富集测序：特异性捕获环状DNA分子
• 数字PCR：准确定量ecDNA拷贝数
• 光学图谱技术：可视化ecDNA大尺度结构
• 染色质构象捕获（Hi-C）：解析ecDNA三维结构
• 纳米孔测序：长读长检测ecDNA复杂变异
• 单细胞测序：分析ecDNA细胞间异质性
• 甲基化芯片：检测ecDNA表观遗传修饰
• 荧光原位杂交（FISH）：ecDNA空间定位
• 电泳脉冲场凝胶电泳：分离大片段ecDNA
• 质谱流式细胞术：ecDNA蛋白复合物分析
• CRISPR-Cas9靶向捕获：特定ecDNA区域富集
• 微滴式数字PCR：超高灵敏度ecDNA检测
• 原子力显微镜：ecDNA物理特性表征
• 流式分选技术：ecDNA阳性细胞分选

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• PacBio Sequel II
• Oxford Nanopore PromethION
• Bio-Rad QX200微滴式数字PCR系统
• 10x Genomics Chromium
• Bionano Saphyr光学图谱仪
• Thermo Fisher QuantStudio
• Agilent 4200 TapeStation
• Nanopore GridION
• Beckman Coulter CytoFLEX
• Zeiss LSM 880共聚焦显微镜
• BioNano Genomics Irys
• Fluidigm C1单细胞制备系统
• Applied Biosystems 3500遗传分析仪
• Bruker Nano表面原子力显微镜