人源肿瘤小鼠表观遗传检测

信息概要

人源肿瘤小鼠表观遗传检测是一种通过将人类肿瘤组织移植到免疫缺陷小鼠体内，模拟肿瘤微环境并研究其表观遗传学变化的先进技术。该检测能够揭示肿瘤发生、发展及治疗响应中的关键表观遗传调控机制，为精准医疗和药物研发提供重要依据。

此类检测的重要性在于，它能够帮助研究者深入理解肿瘤异质性、耐药性以及潜在的治疗靶点，从而加速抗癌药物的筛选和个性化治疗方案的制定。通过表观遗传学分析，可以挖掘DNA甲基化、组蛋白修饰等动态变化，为临床前研究提供可靠的数据支持。

检测项目

• 全基因组DNA甲基化分析
• 启动子区甲基化水平检测
• 组蛋白H3K27me3修饰检测
• 组蛋白H3K4me3修饰检测
• 组蛋白H3K9ac修饰检测
• 染色质可及性分析（ATAC-seq）
• 非编码RNA表达谱分析
• miRNA表达水平检测
• lncRNA表达水平检测
• 环状RNA表达水平检测
• 染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）
• DNA羟甲基化检测
• 转录因子结合位点分析
• 增强子活性检测
• 沉默子活性检测
• 基因组印记分析
• X染色体失活状态检测
• 端粒长度及表观遗传调控检测
• 肿瘤相关基因甲基化标志物筛查
• 表观遗传时钟分析

检测范围

• 人源肿瘤异种移植模型（PDX）
• 人源肿瘤细胞系移植模型（CDX）
• 基因编辑肿瘤小鼠模型
• 免疫缺陷小鼠肿瘤模型
• 原代肿瘤组织移植模型
• 转移性肿瘤小鼠模型
• 耐药性肿瘤小鼠模型
• 放射敏感性肿瘤模型
• 化学诱导肿瘤模型
• 病毒诱导肿瘤模型
• 自发成瘤转基因小鼠模型
• 条件性敲除肿瘤模型
• 组织特异性过表达肿瘤模型
• 肿瘤微环境重构模型
• 肿瘤干细胞移植模型
• 多器官肿瘤模型
• 血液系统肿瘤模型
• 实体瘤模型
• 罕见肿瘤模型
• 患者来源类器官移植模型

检测方法

• 亚硫酸氢盐测序（BS-seq）：用于全基因组DNA甲基化分析
• 甲基化特异性PCR（MSP）：快速检测特定基因甲基化状态
• 焦磷酸测序：定量分析DNA甲基化水平
• 染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）：研究组蛋白修饰及转录因子结合
• 转座酶可及性染色质测序（ATAC-seq）：分析染色质开放区域
• 全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS）：高分辨率甲基化图谱构建
• 甲基化DNA免疫共沉淀测序（MeDIP-seq）：富集甲基化DNA片段
• 简化代表性亚硫酸氢盐测序（RRBS）：经济型甲基化检测
• 单细胞ATAC-seq：单细胞水平染色质可及性分析
• 单细胞甲基化测序：单细胞DNA甲基化分析
• 高通量测序（NGS）：大规模表观遗传数据获取
• 微阵列分析（450K/850K芯片）：中通量甲基化检测
• 质谱法：准确测量DNA羟甲基化水平
• 纳米孔测序：实时检测表观遗传修饰
• 原位杂交（FISH）：空间表观遗传学分析

检测方法

• Illumina NovaSeq 6000测序仪
• ABI 3730xl DNA分析仪
• Nanopore MinION测序仪
• PacBio Sequel II测序系统
• Agilent 2100生物分析仪
• Bio-Rad CFX96实时PCR仪
• Thermo Fisher Qubit荧光计
• Beckman Coulter Biomek液体处理项目合作单位
• Covaris S220超声破碎仪
• Illumina HiSeq X Ten测序仪
• 10x Genomics Chromium系统
• BD FACSAria III流式细胞仪
• Zeiss LSM 880共聚焦显微镜
• Thermo Fisher Orbitrap Fusion质谱仪
• PerkinElmer JANUS自动化项目合作单位