人源肿瘤小鼠甲基化测序测试

信息概要

人源肿瘤小鼠甲基化测序测试是一种基于高通量测序技术的表观遗传学分析服务，专注于研究人源肿瘤异种移植模型（PDX）或转基因小鼠模型中DNA甲基化修饰的动态变化。该检测通过全基因组甲基化测序（WGBS）或靶向甲基化测序技术，揭示肿瘤发生、发展及治疗响应中的甲基化调控机制，为肿瘤精准医疗提供分子层面的数据支持。

检测的重要性体现在：甲基化异常是肿瘤标志物筛选、分子分型和预后评估的关键指标；通过小鼠模型模拟人类肿瘤甲基化特征，可加速药物靶点发现和个性化治疗策略开发；第三方检测机构提供的标准化流程与数据分析确保结果的可重复性和临床转化价值。

检测项目

• 全基因组DNA甲基化水平分析
• 启动子区域甲基化状态检测
• CpG岛甲基化密度计算
• 差异甲基化区域（DMR）鉴定
• 甲基化单倍型分析
• 肿瘤特异性甲基化标志物筛选
• 甲基化驱动基因功能注释
• 甲基化与基因表达关联分析
• 样本间甲基化谱相似性评估
• 甲基化年龄预测
• 拷贝数变异相关甲基化分析
• 甲基化亚型分类
• 肿瘤微环境甲基化特征解析
• 治疗前后甲基化动态变化监测
• 甲基化位点保守性分析
• 跨物种甲基化模式比对
• 甲基化与突变协同分析
• 甲基化信号通路富集分析
• 表观遗传时钟校准
• 技术重复性验证

检测范围

• 人源肿瘤组织异种移植小鼠模型
• 转基因肿瘤小鼠模型
• 条件性基因敲除肿瘤模型
• 化学诱导肿瘤小鼠模型
• 放射诱导肿瘤模型
• 自发成瘤转基因小鼠
• 免疫缺陷小鼠移植模型
• 人源化免疫系统肿瘤模型
• 原代肿瘤细胞移植模型
• 循环肿瘤细胞衍生模型
• 多器官转移瘤模型
• 耐药性肿瘤模型
• 肿瘤干细胞富集模型
• 类器官共移植模型
• 原位移植肿瘤模型
• 微小残留病灶模型
• 多组学整合分析模型
• 治疗响应预测模型
• 肿瘤进化追踪模型
• 微生物组关联肿瘤模型

检测方法

• 全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS）：高分辨率全甲基化图谱分析
• 简化代表性亚硫酸氢盐测序（RRBS）：经济型靶向甲基化检测
• 甲基化DNA免疫共沉淀测序（MeDIP-seq）：抗体富集甲基化片段
• 甲基化敏感限制性内切酶测序（MRE-seq）：酶切法检测非甲基化区域
• 靶向甲基化Panel测序：定制化基因panel深度测序
• 单细胞甲基化测序：单细胞水平表观异质性解析
• 氧化亚硫酸氢盐测序（oxBS-seq）：5hmC与5mC区分检测
• 甲基化特异性PCR（MSP）：快速验证特定位点甲基化
• 焦磷酸测序：定量单碱基分辨率甲基化分析
• 甲基化芯片（Infinium MethylationEPIC）：中通量甲基化筛查
• 纳米孔直接甲基化测序：实时长读长检测
• 液相色谱-质谱（LC-MS）：全局甲基化水平定量
• 甲基化敏感高分辨率熔解曲线（MS-HRM）：低成本快速筛查
• 多重连接依赖性探针扩增（MLPA）：甲基化依赖的拷贝数分析
• 染色质免疫共沉淀甲基化测序（ChIP-MeDIP）：组蛋白修饰与甲基化关联分析

检测仪器

• Illumina NovaSeq 6000
• Illumina HiSeq X Ten
• PacBio Sequel II
• Oxford Nanopore PromethION
• Thermo Fisher Ion GeneStudio S5
• BGI MGISEQ-2000
• Agilent 4200 TapeStation
• Qubit 4.0 Fluorometer
• Covaris M220超声破碎仪
• Bio-Rad CFX96 qPCR仪
• Thermo NanoDrop One
• Eppendorf Centrifuge 5430R
• Beckman Coulter Biomek i7
• Roche LightCycler 480
• Waters Xevo TQ-S LC-MS/MS