新生鼠转录组分析测试

信息概要

新生鼠转录组分析测试是一种通过高通量测序技术对新生鼠基因表达进行全面分析的服务。该检测能够揭示基因在不同发育阶段、病理状态或外界刺激下的表达变化，为科研和医学研究提供重要数据支持。

转录组分析在生物医学研究中具有重要意义，可以帮助研究者了解基因调控机制、发现潜在生物标志物、探索疾病发生发展的分子机制等。该检测服务采用先进的测序技术和生物信息学分析方法，确保数据的准确性和可靠性。

本检测服务适用于各类科研机构、医药研发企业和高校实验室，可为发育生物学、神经科学、药理学等多个领域的研究提供有力支持。

检测项目

• RNA完整性检测
• 总RNA浓度测定
• mRNA富集效率检测
• 文库构建质量评估
• 测序数据质量评估
• 基因表达量分析
• 差异表达基因分析
• 基因功能富集分析
• 信号通路分析
• 可变剪接分析
• 新转录本预测
• lncRNA分析
• miRNA分析
• circRNA分析
• 融合基因检测
• SNP/InDel检测
• 基因共表达网络分析
• 转录因子调控网络分析
• 样本间相关性分析
• 主成分分析

检测范围

• 新生鼠脑组织
• 新生鼠肝脏组织
• 新生鼠心脏组织
• 新生鼠肺组织
• 新生鼠肾脏组织
• 新生鼠脾脏组织
• 新生鼠肠道组织
• 新生鼠肌肉组织
• 新生鼠皮肤组织
• 新生鼠脂肪组织
• 新生鼠骨髓
• 新生鼠外周血
• 新生鼠神经组织
• 新生鼠视网膜
• 新生鼠胰腺组织
• 新生鼠睾丸组织
• 新生鼠卵巢组织
• 新生鼠胎盘组织
• 新生鼠脐带组织
• 新生鼠全胚胎

检测方法

• RNA提取：采用Trizol法或柱式法提取高质量总RNA
• RNA完整性检测：使用Agilent Bioanalyzer进行RIN值测定
• mRNA富集：采用oligo(dT)磁珠法富集真核生物mRNA
• 文库构建：使用Illumina TruSeq试剂盒构建测序文库
• 文库定量：通过qPCR方法准确测定文库浓度
• 高通量测序：采用Illumina平台进行双端测序
• 原始数据质控：使用FastQC进行测序数据质量评估
• 序列比对：采用STAR或HISAT2将reads比对到参考基因组
• 基因定量：使用featureCounts或HTSeq进行基因表达量计算
• 差异分析：采用DESeq2或edgeR进行差异表达基因鉴定
• 功能注释：使用GO数据库进行基因功能注释
• 通路分析：基于KEGG数据库进行信号通路富集分析
• 可变剪接分析：采用rMATS进行可变剪接事件检测
• 融合基因检测：使用STAR-Fusion或FusionCatcher进行分析
• SNP检测：采用GATK进行单核苷酸多态性检测

检测仪器

• Nanodrop分光光度计
• Agilent 2100 Bioanalyzer
• Qubit荧光定量仪
• Thermal Cycler PCR仪
• Covaris超声破碎仪
• 磁力架
• 离心机
• Illumina测序仪
• 电泳系统
• 实时荧光定量PCR仪
• 超低温冰箱
• 生物安全柜
• 恒温金属浴
• 振荡器
• 微量移液器