全基因组DNA甲基化测序测试

信息概要

全基因组DNA甲基化测序测试是一种高通量测序技术，用于检测基因组范围内的DNA甲基化状态。DNA甲基化是表观遗传修饰的重要形式，涉及在CpG岛、基因启动子等区域的胞嘧啶上添加甲基基团，从而调控基因表达。该检测对于理解发育、疾病机制（如癌症、神经退行性疾病）、环境暴露影响以及个性化医疗至关重要。通过此测试，可以全面分析甲基化模式，为生物标志物发现和药物开发提供关键数据。

检测项目

• 全基因组甲基化水平分析
• CpG岛甲基化状态
• 启动子区域甲基化检测
• 基因体甲基化模式
• 差异甲基化区域识别
• 甲基化等位基因频率
• 甲基化热点分析
• 非CpG甲基化检测
• 甲基化与基因表达关联
• 组织特异性甲基化
• 发育阶段甲基化变化
• 环境因素诱导甲基化
• 疾病相关甲基化标记
• 甲基化稳定性评估
• 表观遗传年龄分析
• 甲基化与SNP整合
• 甲基化异质性检测
• 甲基化克隆性分析
• 甲基化与染色质状态
• 甲基化重复序列分析
• 甲基化印记区域
• 甲基化与X染色体失活
• 甲基化与干细胞分化
• 甲基化与药物反应
• 甲基化质量控制参数
• 甲基化数据标准化
• 甲基化统计显著性
• 甲基化可视化分析
• 甲基化数据库比对
• 甲基化生物信息学注释

检测范围

• 人类全基因组DNA
• 小鼠全基因组DNA
• 大鼠全基因组DNA
• 植物全基因组DNA
• 细菌全基因组DNA
• 真菌全基因组DNA
• 病毒全基因组DNA
• 癌症组织样本
• 正常组织样本
• 血液样本
• 唾液样本
• 尿液样本
• 脑组织样本
• 肝脏组织样本
• 心脏组织样本
• 胚胎干细胞
• 诱导多能干细胞
• 外周血单核细胞
• 肿瘤细胞系
• 环境暴露样本
• 老化组织样本
• 遗传病样本
• 神经退行性疾病样本
• 自身免疫病样本
• 代谢疾病样本
• 感染性疾病样本
• 药物处理样本
• 饮食干预样本
• 运动干预样本
• 转基因生物样本

检测方法

• 亚硫酸氢盐测序法：通过亚硫酸氢盐处理将未甲基化胞嘧啶转化为尿嘧啶，然后进行测序。
• 全基因组重亚硫酸氢盐测序：高通量版本，覆盖全基因组范围。
• 简化代表性亚硫酸氢盐测序：针对特定区域进行测序。
• 甲基化DNA免疫沉淀测序：使用抗体富集甲基化DNA后测序。
• 甲基化敏感限制性内切酶测序：利用酶切差异分析甲基化。
• 单细胞甲基化测序：在单细胞水平分析甲基化。
• 长读长甲基化测序：使用PacBio或Oxford Nanopore技术。
• 靶向甲基化测序：针对特定基因或区域进行深度测序。
• 甲基化芯片分析：使用微阵列技术进行高通量检测。
• 甲基化特异性PCR：通过PCR扩增检测甲基化状态。
• 焦磷酸测序：定量分析特定CpG位点甲基化。
• 甲基化敏感高分辨率熔解曲线分析：基于DNA熔解特性。
• 甲基化荧光原位杂交：结合荧光检测甲基化。
• 甲基化质谱分析：使用质谱技术定量甲基化。
• 甲基化生物信息学分析：通过软件工具处理测序数据。
• 甲基化比对与注释：将测序数据与参考基因组比对。
• 差异甲基化分析：统计比较不同样本间甲基化差异。
• 甲基化聚类分析：识别甲基化模式聚类。
• 甲基化网络分析：构建甲基化与基因调控网络。
• 甲基化验证实验：如Sanger测序验证关键位点。

检测仪器

• Illumina测序仪
• PacBio测序仪
• Oxford Nanopore测序仪
• 亚硫酸氢盐转化试剂盒
• DNA提取仪
• qPCR仪
• 微阵列扫描仪
• 质谱仪
• 荧光显微镜
• 生物分析仪
• 核酸定量仪
• 离心机
• 恒温箱
• 电泳仪
• 超低温冰箱

全基因组DNA甲基化测序测试常见问题：1. 全基因组DNA甲基化测序适用于哪些疾病研究？它常用于癌症、神经退行性疾病和遗传病的表观遗传机制研究。2. 如何确保全基因组DNA甲基化测序数据的准确性？通过使用标准化的亚硫酸氢盐处理、高质量DNA提取和生物信息学验证来提高准确性。3. 全基因组DNA甲基化测序与靶向测序有何区别？全基因组测序覆盖整个基因组，适合发现新标记；靶向测序聚焦特定区域，成本更低且深度更高。