基因表达谱（qPCR/RNA-seq）分析检测

信息概要

基因表达谱分析检测是通过qPCR（实时定量PCR）或RNA-seq（RNA测序）技术，对生物样本中基因的表达水平进行定量或定性评估的服务。该检测能够揭示不同生理或病理状态下基因的表达变化，对于疾病诊断、药物研发、生物标志物发现以及基础生物学研究具有重要意义。通过准确测量mRNA水平，检测有助于理解基因调控机制、识别关键通路，并支持个性化医疗决策。

检测项目

• 总RNA提取与质量评估
• cDNA合成效率验证
• 基因表达相对定量分析
• 绝对定量标准曲线建立
• 表达差异倍数计算
• 基因表达水平归一化
• RNA完整性检测
• 引物特异性验证
• 扩增效率评估
• 熔解曲线分析
• 基因表达聚类分析
• 通路富集分析
• 差异表达基因筛选
• 基因本体分析
• 转录本异构体检测
• 表达稳定性评估
• RNA-seq reads比对
• 表达量TPM计算
• FPKM/RPKM标准化
• 基因融合事件检测
• 可变剪接分析
• 新转录本预测
• 表达相关性分析
• 样本间一致性检验
• 批次效应校正
• 基因表达热图生成
• 主成分分析
• 生存分析关联
• miRNA表达谱检测
• 长非编码RNA分析

检测范围

• 人类组织样本
• 动物模型样本
• 植物组织样本
• 微生物样本
• 细胞培养物
• 血液样本
• 肿瘤组织
• 脑组织
• 肝脏组织
• 心脏组织
• 肾脏组织
• 肺组织
• 皮肤样本
• 骨髓样本
• 唾液样本
• 尿液样本
• 粪便样本
• 石蜡包埋组织
• 冷冻组织
• 单细胞样本
• 外泌体RNA
• 血浆游离RNA
• 血清样本
• 脑脊液样本
• 精液样本
• 羊水样本
• 胎盘组织
• 胚胎组织
• 干细胞样本
• 病原体感染样本

检测方法

• SYBR Green法qPCR，使用荧光染料检测扩增产物
• TaqMan探针法qPCR，基于水解探针实现特异性检测
• 数字PCR，提供绝对定量和高灵敏度
• RNA-seq全转录组测序，高通量分析基因表达
• RT-qPCR，逆转录后实时定量PCR检测
• 微阵列分析，通过杂交检测表达水平
• Northern blotting，传统RNA检测方法
• 原位杂交，组织原位基因表达定位
• RNA测序文库构建，包括片段化和接头连接
• 差异表达分析，使用软件如DESeq2或edgeR
• 基因集富集分析，评估通路活性
• 主成分分析，可视化样本间差异
• 聚类分析，分组相似表达模式
• 生存分析，关联表达与临床结局
• 质量控制检查，确保数据可靠性
• 标准化处理，消除技术变异
• 比对算法，如STAR或HISAT2
• 计数矩阵生成，汇总基因表达值
• 可变剪接检测，使用工具如rMATS
• 新基因预测，基于从头组装

检测仪器

• 实时荧光定量PCR仪
• 高通量测序仪
• 微量分光光度计
• 生物分析仪
• 核酸提取仪
• 离心机
• 恒温混匀仪
• 电泳系统
• 凝胶成像系统
• 超低温冰箱
• 移液器
• 水浴锅
• 核酸定量仪
• 振荡器
• 无菌工作台

基因表达谱分析检测中，qPCR和RNA-seq各有什么优势？qPCR适用于低通量、快速定量，成本较低；RNA-seq则提供全转录组覆盖和高灵敏度，适合发现新转录本。如何进行基因表达谱数据的质量控制？通过评估RNA完整性、扩增效率和测序深度，使用软件工具进行过滤和标准化。基因表达谱检测在疾病诊断中如何应用？它可以识别生物标志物，辅助癌症分型、传染病检测和药物反应预测，提升精准医疗水平。