全基因组甲基化测试

信息概要

全基因组甲基化测试是一种用于分析基因组中所有CpG位点甲基化状态的高通量检测技术。该检测通过识别DNA分子上甲基化修饰的分布和水平，为表观遗传学研究提供全面数据。全基因组甲基化测试在疾病机制研究、生物标志物发现、发育生物学及个性化医疗等领域具有重要价值，能够揭示基因表达调控、细胞分化及环境因素对基因功能的影响。

检测项目

• 全基因组CpG岛甲基化水平
• 启动子区域甲基化状态
• 基因体甲基化密度
• 差异甲基化区域分析
• 甲基化变异频率
• 全局甲基化百分比
• 组织特异性甲基化模式
• 年龄相关甲基化变化
• 环境暴露相关甲基化标记
• 疾病特异性甲基化特征
• 等位基因特异性甲基化
• 非CpG甲基化检测
• 甲基化与基因表达关联分析
• 甲基化稳定性评估
• 表观遗传时钟分析
• 甲基化组学数据整合
• 样本间甲基化一致性
• 甲基化定量准确性
• 低甲基化区域检测
• 高甲基化区域检测
• 甲基化位点验证
• 批次效应校正
• 甲基化数据标准化
• 功能注释甲基化位点
• 甲基化与SNP关联分析
• 甲基化动态变化监测
• 甲基化生物信息学分析
• 质量控制参数评估
• 甲基化重复性测试
• 甲基化敏感性分析

检测范围

• 人类全血样本
• 动物组织样本
• 植物基因组样本
• 细胞系培养物
• 肿瘤组织标本
• 胚胎发育样本
• 神经组织样本
• 微生物基因组
• 古DNA样本
• 体液样本如唾液
• 法医生物学样本
• 环境DNA样本
• 转基因生物样本
• 干细胞样本
• 器官移植样本
• 老化研究样本
• 疾病模型样本
• 药物处理样本
• 营养干预样本
• 应激反应样本
• 遗传病样本
• 癌症筛查样本
• 免疫细胞样本
• 生殖细胞样本
• 微生物组样本
• 表观遗传药物样本
• 环境毒素暴露样本
• 发育生物学样本
• 个性化医疗样本
• 生物标志物研究样本

检测方法

• 亚硫酸氢盐测序法 通过亚硫酸氢盐处理将未甲基化胞嘧啶转化为尿嘧啶后进行测序
• 甲基化DNA免疫沉淀法 使用抗体富集甲基化DNA片段进行高通量分析
• 简化代表性亚硫酸氢盐测序 降低成本的全基因组甲基化检测方法
• 全基因组甲基化芯片 利用微阵列技术快速筛查甲基化位点
• 甲基化敏感性限制性内切酶法 通过酶切差异检测甲基化状态
• 单分子实时测序 直接检测DNA甲基化修饰无需化学处理
• 焦磷酸测序 定量分析特定CpG位点的甲基化水平
• 甲基化特异性PCR 针对甲基化序列进行扩增检测
• 高通量测序结合生物信息学 整合数据分析甲基化模式
• 纳米孔测序技术 实时长读长检测甲基化修饰
• 液相色谱质谱法 准确测量全局甲基化水平
• 甲基化荧光定量法 使用荧光探针检测甲基化密度
• 甲基化芯片数据分析 通过软件工具解析芯片结果
• 甲基化单倍型分析 研究甲基化在染色体上的分布
• 差异甲基化区域识别 比较样本间甲基化差异区域
• 甲基化与组蛋白修饰关联分析 整合多组学数据
• 机器学习预测甲基化 利用算法模型分析甲基化模式
• 甲基化动态建模 模拟甲基化随时间的变化
• 甲基化验证实验 通过Sanger测序确认关键位点
• 甲基化数据可视化 生成图谱展示甲基化分布

检测仪器

• Illumina测序仪
• 亚硫酸氢盐转化试剂盒
• 实时荧光定量PCR仪
• 纳米孔测序设备
• 液相色谱质谱联用仪
• DNA甲基化芯片扫描仪
• 生物分析仪
• 高通量核酸提取系统
• 甲基化特异性PCR仪
• 焦磷酸测序仪
• 紫外分光光度计
• 凝胶成像系统
• 离心机
• 恒温孵育箱
• 生物信息学服务器

全基因组甲基化测试在癌症早期诊断中有什么应用？全基因组甲基化测试如何帮助研究环境因素对基因的影响？进行全基因组甲基化测试需要哪些样本准备步骤？