土壤微生物多样性研究样品

信息概要

• 土壤微生物多样性研究样品检测通过分析微生物群落结构、功能基因和代谢活性，评估土壤生态系统健康状况。
• 检测可揭示土壤肥力变化、污染物降解能力及生态恢复潜力，对农业可持续发展和环境修复具有关键指导意义。
• 本服务覆盖微生物分类鉴定、功能基因检测及代谢产物分析，提供符合ISO 11063和GB/T 32720等标准的报告。

检测项目

• 细菌16S rRNA基因测序
• 真菌ITS区域测序
• 放线菌特异性基因检测
• 古菌多样性分析
• 微生物生物量碳测定
• 微生物生物量氮测定
• 磷脂脂肪酸(PLFA)谱图分析
• 土壤酶活性(脲酶)检测
• 土壤酶活性(磷酸酶)检测
• 固氮菌丰度定量
• 解磷菌计数分析
• 氨氧化细菌功能基因检测
• 反硝化细菌功能基因检测
• 抗生素抗性基因筛查
• 微生物代谢熵测定
• 微生物群落功能多样性(Biolog)
• 微生物碳源利用率分析
• 病原微生物风险评估
• 微生物群落结构聚类分析
• α多样性指数(Shannon)
• β多样性指数(PCoA)
• 系统发育多样性指数
• 微生物网络互作分析
• 关键物种指示值分析
• 微生物功能预测(PICRUSt)
• 宏基因组组装分析
• 病毒组多样性检测
• 微生物耐盐基因检测
• 有机污染物降解菌筛查
• 重金属抗性基因定量
• 微生物生长曲线测定
• 微生物呼吸强度检测

检测范围

• 变形菌门(Proteobacteria)
• 厚壁菌门(Firmicutes)
• 放线菌门(Actinobacteria)
• 拟杆菌门(Bacteroidetes)
• 酸杆菌门(Acidobacteria)
• 绿弯菌门(Chloroflexi)
• 芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)
• 子囊菌门(Ascomycota)
• 担子菌门(Basidiomycota)
• 接合菌门(Zygomycota)
• 球囊菌门(Glomeromycota)
• 古菌域(Archaea)
• 丝状真菌(Filamentous fungi)
• 酵母菌(Yeast)
• 固氮菌属(Azotobacter)
• 根瘤菌属(Rhizobium)
• 假单胞菌属(Pseudomonas)
• 芽孢杆菌属(Bacillus)
• 链霉菌属(Streptomyces)
• 木霉属(Trichoderma)
• 青霉属(Penicillium)
• 曲霉属(Aspergillus)
• 丛枝菌根真菌(AMF)
• 硝化细菌(Nitrifying bacteria)
• 反硝化细菌(Denitrifying bacteria)
• 纤维素分解菌
• 木质素降解菌
• 甲烷氧化菌
• 硫酸盐还原菌
• 铁还原菌
• 极端嗜盐菌
• 耐重金属菌株

检测方法

• 高通量测序技术：基于Illumina平台进行微生物群落基因序列分析
• 实时荧光定量PCR：准确定量特定功能基因表达水平
• 宏基因组测序：全面解析微生物群落功能基因组成
• PLFA分析：通过磷脂脂肪酸谱鉴定微生物群落结构
• Biolog ECO板：测定微生物群落碳源代谢功能多样性
• 克隆文库构建：用于稀有微生物物种的鉴定分析
• DGGE/TGGE：微生物群落结构的指纹图谱分析
• 荧光原位杂交：原位观察特定微生物的空间分布
• 稳定性同位素探针：追踪功能微生物的代谢活性
• 酶联免疫吸附：快速检测特定微生物抗原
• 微量热法：实时监测微生物代谢热变化
• 气相色谱-质谱：分析微生物挥发性代谢产物
• 傅里叶红外光谱：表征微生物细胞组分特征
• 流式细胞术：快速计数和分选微生物细胞
• 激光共聚焦显微镜：三维观测微生物生物膜结构
• 代谢组学分析：全面鉴定微生物小分子代谢物
• 蛋白组学分析：研究微生物蛋白质表达谱
• 转录组测序：分析微生物基因表达调控网络
• 纳米孔测序：实现长读长实时微生物基因组测序
• 单细胞基因组学：获取未培养微生物遗传信息

检测仪器

• Illumina NovaSeq测序仪
• QuantStudio实时荧光定量PCR仪
• Nanopore PromethION测序仪
• 气相色谱-质谱联用仪
• 液相色谱-高分辨质谱仪
• 傅里叶变换红外光谱仪
• 激光共聚焦显微镜
• 流式细胞分选仪
• 微量热分析仪
• Biolog微生物鉴定系统
• 全自动酶标仪
• 超液相色谱仪
• 核酸蛋白分析仪
• 脉冲场电泳系统
• 微生物发酵罐系统